1. R和Rstudio

本章节主要为R和Rstudio的介绍和基本安装方式。

1.1 R的基本介绍

R语言的特点：

• 自由软件，免费、开放源代码，支持各个主要计算机系统；
• 完整的程序设计语言，基于函数和对象，可以自定义函数，调入C、C++、Fortran编译的代码；
• 具有完善的数据类型，如向量、矩阵、因子、数据集、一般对象等，支持缺失值;
• 强调交互式数据分析，支持复杂算法描述，图形功能强;
• 实现了经典的、现代的统计方法，如参数和非参数假设检验、线性回归、广义线性回归、非线性回归、可加模型、树回归、混合模型、方差分析、判别、聚类、时间序列分析等。
• 统计科研工作者广泛使用R进行计算和发表算法。

1.2 R的安装方式

R的官方网站为https://www.r-project.org/

官方镜像网站为https://cran.r-project.org/mirrors.html

国内常用清华镜像为https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

下载官方的R软件后按提示安装，安装后获得一个桌面快捷方式，即可在视窗界面中运行。但是一般情况下，我们可以选择在Rstudio中运行R，详情如下。

1.3 Rstudio的基本介绍

RStudio软件是R软件的应用界面与增强系统， 可以在其中编辑、运行R的程序文件， 可以跟踪运行， 还可以构造文字、R结果图表融合在一起的研究报告、论文、图书、网站等。界面一般分为四个窗格， 其中编辑窗口与控制台（Console）是最重要的两个窗格。 编辑窗格用来查看和编辑程序、文本型的数据文件、程序与文字融合在一起的Rmd文件等。 控制台与基本R软件的命令行窗口基本相同， 功能有所增强。在编辑窗口中可以用操作系统中常用的编辑方法对源文件进行编辑， 如复制、粘贴、查找、替换， 还支持基于正则表达式的查找替换。

其它的一些重要窗格包括：

• Files: 列出当前项目的目录（文件夹）内容。 其中以.R或者.r为扩展名的是R源程序文件， 单击某一源程序文件就可以在编辑窗格中打开该文件；
• Plots: 如果程序中有绘图结果， 将会显示在这个窗格。 因为绘图需要足够的空间， 所以当屏幕分辨率过低或者Plots窗格太小的时候， 可以点击“Zoom”图标将图形显示在一个单独的窗口中， 或者将图形窗口作为唯一窗格显示。 如何放大窗格见下面的使用技巧；
• Help: R软件的文档与RStudio的文档都在这里；
• Environment: 已经有定义的变量、函数都显示在这里；
• History: 以前运行过的命令都显示在这里。 不限于本次RStdudio运行期间， 也包括以前使用RStudio时运行过的命令；
• Packages: 显示已安装的R扩展包及其文档；
• Viewer, Connection, Build, Git等窗格；

1.4 Rstudio的安装方式

RStudio的官方网站为https://www.rstudio.com/

下载地址为https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download

对普通研究者，只需要选择自己对应操作系统免费版本即可。安装后，一般情况下RStudio会自动寻找系统内的R程序。如果在系统内存在多个R版本，可以在Tools选项下Global Options中选择所需R的安装目录即可。